本系统所用技术:
IDEA、PigX、maven、MySql、MangoDB、VUE、Java、Redis。
本项目建设着眼于构建适应疫情防控新形势和当今新技术能力的崭新致病菌数据分析溯源工作新机制,以生物学的各种实验数据作为输入数据,以云平台、大数据等高性能计算为支撑,对实验数据进行管理、比对、分析、溯源和预警,实现疾病防控等相关致病菌数据的高效存储、处理分析和溯源预警能力。
(一)建设全基因组数据库
为微生物致病菌分溯源提供易用的全基因测序数据管理工具,构建一个微生物致病菌全基因组数据库;
(二)建设全基因数据在线分析平台
为一线人员提供高效的微生物全基因数据在线分析平台,满足菌种鉴定、拼接、wgMLST、wgSNP的分析手段需要;
(三)建设致病菌风险监测预警溯源平台
为各类行业机构提供基于菌毒株致病性、变异性、聚类等生物学特征分析的精准性致病菌风险监测预警溯源平台,实现疫情暴发预警和流行病学预测,解决疾控传染病防治和疫情监测等需求。
(四)提供“一站式”综合服务
通过本项目建设,可以构建一套集数据管理、序列编辑、序列比对、进化分析、引物设计以及风险评估等功能于一体的系统平台,全面提升系统集成度,简化病原体数据分析流程,从而达到对病原体相关数据进行“一站式”便捷分析、风险评估和溯源预警的目的。
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