1.背景降噪系统研发(基于UMI处理)
• 基于UMI处理,从不同角度比较sentieon和fgbio处理的效果,挑选合适的工具为后续的变异检测做准备。
2.高通量测序性能评价
• 根据不同的性能参数,挑选适合人和微生物的测序平台。
3. MSI检测流程开发
• 研究内容是调研MSI相关信息,根据市场产品参数制定标准,筛选工具算法并进行对比,利用模拟数据搭建开发流程。
4. 以单细胞转录组技术解析近视形成过程中巩膜异质性变化特征
• 研究内容是全面解析巩膜组织细胞细胞组成特征,获取近视形成过程中巩膜成纤维细胞的亚类分布及变化特征,获取特异
性基因等
5. DNA甲基化报告系统开发
• 基于R的DNA甲基化芯片基础分析及报告系统。
6. 基于GEO数据库的肿瘤药物靶点发现
• 基于GEO数据库,利用python和R进行单细胞分析发现肿瘤药物靶点。