1.代码开发:可基于R/Python/Linux独立从0编写转录组、单细胞、空间转录组、临床生信全流程分析代码,具备针对高分项目的定制化代码开发与优化能力,代码复用性与适配性高。
2.生信分析:精通3-10分文章各类经典及进阶分析方法,包括差异分析、WGCNA、PPI/TF网络、Cox回归、拟时序分析、细胞通讯、高级免疫浸润、多组学整合分析、孟德尔随机化、compass、scFEA、虚拟敲除等,累计完成30+项目分析。
3.方案设计:具备3-5分项目生信分析方案设计能力,可结合研究方向与期刊要求,提供科学、可行的分析思路与技术选型建议。
4.工具软件:熟练使用NOVOplasty、Geneious、MEGA、mVISTA等基因组分析软件,熟悉各类生信在线工具、数据库及可视化工具,适配不同分值项目分析需求。
5.编程基础:精通R语言(生信分析核心工具)、Python、Linux,掌握C++、汇编语言,可独立编写、调试、优化分析脚本,具备新方向技术开发能力。
6.业务对接:具备高效的科研团队/客户沟通能力,能精准解读需求、讲解分析结果,助力项目成果落地与文章发表。
2025.08-2026.02 单细胞多组学整合孟德尔随机化探索帕金森病和脊柱畸形之间共享遗传和因果效应并解析潜在分子机制 预计影响因子:10
使用LDSC、双样本孟德尔随机化、eQTL孟德尔、pqtl孟德尔、TWAS、PheWAS、deTs、webCSEA、转录组(差异分析、机器学习)、单细胞(差异分析、富集分析、scMetabolism、TF转录因子、拟时序、细胞通讯、虚拟敲除)、空间转录组(表达分析、通讯分析)对项目进行分析,通过因果遗传关系锁定共病基因和细胞,研究细胞分化特征最终确定基因和细胞作用区域
2025.04-2025.08 单细胞整合多组学探索瘢痕疙瘩形成机制和治疗特征 预计影响因子:10
使用单细胞(hallmark分析、富集分析、免疫原性分析、干性分析、通路分析、细胞通讯、拟时序分析、TF转录因子)对项目进行分析,通过干性和通路结果锁定瘢痕生成细胞类型和机制,结合临床数据分析锁定治疗手段
2024.01-2024.02 鉴定肝癌患者继发血栓的高危因素和循环生物标志物并构建预测模型——孟德尔随机化分析 预计影响因子:5
使用双样本孟德尔随机化、eqtl孟德尔随机化、共定位、转录组(差异分析、富集分析、免疫浸润分析、ssgsea、机器学习)对项目进行分析,通过因果关系确定致病细胞和致病基因,之后在转录组中进行验证并找出相关细胞和通路