刘莹

高级生物信息工程师
华大基因 · 9年经验
刘莹
日薪: ¥500/8h
地点: 上海
时间: 下班后周六周日可工作日远程
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AI 技能提取 | Python 机器学习 Linux
熟练运用 Linux,精通 Python、Perl、R 语言,具备机器学习、统计建模和流程工程化经验。
熟练运用 ChatGPT、Copilot、DeepSeek 等 AI 工具提高研发与交付效率。
擅长生物信息流程开发、NGS 自动化平台建设、肿瘤与制药质控相关软件开发。

外源因子检测数据库构建
围绕支原体、分枝杆菌、真菌、细菌及 BCC 等外源因子开展本地化数据库建设,负责参考序列整理、质量控制、覆盖评估及来源追溯,形成高置信序列库、候选序列库、QC 结果表及标准化交付文档,为 NAT/HTS 外源因子检测提供可复核、可审计的数据库基础。

甲状腺癌早筛甲基化 Panel 开发
独立主导甲状腺癌早筛甲基化 Panel 生信研发,完成 104 例临床样本的数据处理、特征筛选及模型评估,筛选出具有较高良恶性区分能力的甲基化 Marker 组合,推动项目进入临床验证及知识产权转化阶段。

泛癌种捕获 Panel 生信分析流程搭建与优化
负责公司核心泛癌种 NGS 捕获 Panel 生信流程的搭建与持续优化,围绕比对、降噪、变异检测等关键环节开展算法评测和参数调优,提升检测灵敏度与特异性;同时开发融合、MSI、化疗药物基因型判定等临床分析模块,支撑 LDT 产品稳定交付。

肿瘤 NGS 临床报告自动化系统
负责肿瘤 NGS 自动化分析系统核心报告模块开发,使用 Python/Perl/MySQL 实现变异信息自动查询、提取、格式化及 PDF 报告生成,将报告生成效率提升 90% 以上,减少人工操作及录入错误,提升临床样本交付效率与一致性。

临床用药及肿瘤变异智能解读系统
独立设计临床用药智能推荐系统,并参与肿瘤体细胞变异自动解读与评级系统开发,实现基因型解析、药物数据库匹配及基于 AMP/ASCO/CAP 指南的自动评级;两项系统均完成软件化落地并获得国家软件著作权。

NGS 分析流程性能优化与全球部署
负责 WGS、RNA-seq 等生产级 NGS 流程开发、部署和持续优化,并完成海外多个计算集群的标准化部署。通过算法及流程优化,将项目平均分析周期缩短约 20%,高并发商业项目期间实现零因生信流程问题导致的项目延期。
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刘莹

高级生物信息工程师 · 9年经验 · 华大基因
城市上海 日薪500元/8h 时间 下班后周六周日可工作日远程
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技术能力

AI 技能提取 | Python 机器学习 Linux
熟练运用 Linux,精通 Python、Perl、R 语言,具备机器学习、统计建模和流程工程化经验。
熟练运用 ChatGPT、Copilot、DeepSeek 等 AI 工具提高研发与交付效率。
擅长生物信息流程开发、NGS 自动化平台建设、肿瘤与制药质控相关软件开发。

项目经验

外源因子检测数据库构建
围绕支原体、分枝杆菌、真菌、细菌及 BCC 等外源因子开展本地化数据库建设,负责参考序列整理、质量控制、覆盖评估及来源追溯,形成高置信序列库、候选序列库、QC 结果表及标准化交付文档,为 NAT/HTS 外源因子检测提供可复核、可审计的数据库基础。

甲状腺癌早筛甲基化 Panel 开发
独立主导甲状腺癌早筛甲基化 Panel 生信研发,完成 104 例临床样本的数据处理、特征筛选及模型评估,筛选出具有较高良恶性区分能力的甲基化 Marker 组合,推动项目进入临床验证及知识产权转化阶段。

泛癌种捕获 Panel 生信分析流程搭建与优化
负责公司核心泛癌种 NGS 捕获 Panel 生信流程的搭建与持续优化,围绕比对、降噪、变异检测等关键环节开展算法评测和参数调优,提升检测灵敏度与特异性;同时开发融合、MSI、化疗药物基因型判定等临床分析模块,支撑 LDT 产品稳定交付。

肿瘤 NGS 临床报告自动化系统
负责肿瘤 NGS 自动化分析系统核心报告模块开发,使用 Python/Perl/MySQL 实现变异信息自动查询、提取、格式化及 PDF 报告生成,将报告生成效率提升 90% 以上,减少人工操作及录入错误,提升临床样本交付效率与一致性。

临床用药及肿瘤变异智能解读系统
独立设计临床用药智能推荐系统,并参与肿瘤体细胞变异自动解读与评级系统开发,实现基因型解析、药物数据库匹配及基于 AMP/ASCO/CAP 指南的自动评级;两项系统均完成软件化落地并获得国家软件著作权。

NGS 分析流程性能优化与全球部署
负责 WGS、RNA-seq 等生产级 NGS 流程开发、部署和持续优化,并完成海外多个计算集群的标准化部署。通过算法及流程优化,将项目平均分析周期缩短约 20%,高并发商业项目期间实现零因生信流程问题导致的项目延期。
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